然而，在小公主芷熙身上却出现了问题，全宇宙没有与她匹配的生命密码，导致她失去了生命能量源。
为什么会出现这样的意外？这涉及到库矩星球的一个大阴谋，而隐藏其中的最大秘密只有白水钦知道。
139亿年前，在旧宇宙消亡的前夕，旧宇宙仅存的文明世界库矩星球制定了库矩星基因大转移计划。
大家一致推举库矩星的大宗主，由他携带储存库矩星球全体生命信息的源体接片，穿越大爆炸去往新宇宙。
原来的计划是，为了穿越宇宙大爆炸，大宗主先毁灭自己的原身，只保存一组源始能密码。等到成功穿越宇宙大爆炸之后，大宗主与芷熙在新宇宙完成密码对接，复制生命之源，使全体库矩基因再次苏醒，恢复原身，重建新世界！
可是，谁也没有料到，库矩星球出了叛逆！
就在库矩星球灭亡的前夜，二宗主与掌管库矩基因库的科研人员林霍恩联手，偷偷地在源体接片上输入了阻止大宗主密码苏醒、恢复原身的指令。为了预防芷熙排除障碍跟大宗主完成生命密码对接，二宗主还封禁了源体接片内芷熙的密码。
貌似二宗主和林霍恩如愿以偿了。大宗主携带储存库矩星全体生命信息的源体接片成功穿越到新宇宙，源体接片中也包含二宗主和林霍恩的生命信息，二宗主和林霍恩如愿率先在新宇宙苏醒。
二宗主苏醒后立即搜索大宗主还未苏醒的生命密码，他要在自己身上重组这套密码，然后激活新密码，使自己完全替代大宗主。
可是，大宗主成功穿越到新宇宙之后，他那看不见的源始能密码却神秘地消失在新宇宙的进化蓝图中。
二宗主无法复原大宗主密码，就迫不及待地打开源体接片寻找芷熙的生命密码。
因为芷熙的生命密码与大宗主的完全一致，他也可以在自己身上复制大宗主的基因蓝图。哪知，源体接片内根本没有芷熙的生命密码！
原来，在库矩星灭亡的前夜，库矩星球修基会的长老白水钦，识破了二宗主的阴谋。可那时大宗主已经转变为看不见的生命能量体，粉碎二宗主的阴谋已经来不及了。
危急之时，白水钦复制了库矩星基因苏醒程序，偷偷地将芷熙的生命密码移出了源体接片。
在大宗主设计的库矩星基因大转移计划成功实施的同时，白水钦暗中设置了另一条源始能通道，携带芷熙的生命密码也成功地穿越到了新宇宙。
遗憾的是，二宗主指使林霍恩暗中输入的指令已经奏效，大宗主生命密码神秘消失，他的原体在新宇宙的黑暗天体中成了被封禁的超能体。
大宗主更是错过了生命密码对接的时间，除非宇宙中出现名为空白垠的超能量源，否则，没有哪种能量可以唤醒他！
二宗主无法复制大宗主的基因蓝图，他想在新宇宙替代大宗主成为宇宙真神的计划也落了空。他和林霍恩再次合作，在他俩的能力范围内解密出了源体接片内的一部分库矩基因。源体接片内还有更多他俩无法解密的基因，全部被封禁在宇宙的重叠时空。
1500万年前，二宗主锁定了一个星球。
他和林霍恩带着那些苏醒的库矩基因体降临该星球，他们成了这个星球上智慧生物的原始祖先。但是，那些苏醒的库矩基因体一直未向人类方向进化。
智谋深险的二宗主并未在这个星球上公开称神，而是让利令智昏的林霍恩成为挡箭牌。万一哪天大宗主突然出现在这个宇宙，就由林霍恩先为他抵挡危险。
即使这样，二宗主还是不能安心，他率领一批库矩星基因的苏醒者，以重塑原身来隐藏自己，然后，突然从这个星球上消失了。
直到这时，林霍恩才渐渐地醒悟过来，原来自己一直被二宗主当枪使。很快，林霍恩搜索到宇宙蓝图中有大宗主的活动信息。他于是推测，大宗主在参与设计宇宙进化的蓝图，他总有一天会回归。到那时，他定会惩治库矩星球的叛逆！
必须摆脱被二宗主暗中操控的命运，而且还要在大宗主降临之前获得与之抗衡的实力！
林霍恩开始改变这个星球的库矩基因，这样他既有了能隐藏自己的伪装，最终还要让变异的库矩基因只听命于他。
800万年前，林霍恩创造了这个星球上最早的原生人类，也就是一源人。
随后，他又计划将已经解密的库矩星基因隐藏在一部分一源人身上，将之改造成二源人。
然而，凭他的能力，创造生命系统非常简单的一源人没有问题，要将一源人改造成系统极其复杂的二源人，尤其要恢复二源人身上被封禁的天然超能力，林霍恩根本无法实现。
这个时候，隐藏在重叠时空中的白水钦看到了机会。他从源体接片中解开了一组与他源始能密码最为吻合的基因蓝图，也就是当今皇后的原始基因。
白水钦重组了新的库矩基因生命之源，他借着林霍恩制造二源人的机会，复制出与芷熙生命密码匹配的超能体密码，一旦能成功连接，芷熙就能拥有属于她的生命能量源。
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