于是，彭祖师不计前嫌，让韩山童做了白莲教教主，至于徐寿辉，则是做了副教主。
几月后，韩山童北上，与白莲教首席大长老刘福通，以白莲教弟子为基础，发动了大起义，正式竖起了反元大旗。
随后，彭祖师坐镇总坛，指挥副教主徐寿辉发动了起义，与教主韩山童南北呼应，共同反元。
其时，明教和弥勒教早已同白莲教结盟，三教弟子所到之处，民众纷纷加入。
而为了一致反元，无论是哪一教的人，都以红巾裹头，被时人成为‘红巾军’。
短短不到一年，红巾军的声势已过百万，元廷惊怒交加。
可是就在这时，明教出了一位叛徒，不但杀害了明教教主，而且还把三教的计划出卖给元廷。
明教教众发誓要将这个叛徒碎尸万段，同时还立下誓言，谁要是亲手杀了此人，谁就是明教教主。
刚巧这个叛徒带领一班元廷高手攻击白莲教主韩山童的部众，双方血战了七天七夜，均是伤亡惨重。
彭祖师得知这个消息以后，急忙赶去救助韩山童，并在紧急关头击杀了明教的那个叛徒，但却把功劳让给了韩山童，让韩山童做了明教教主。
于是，韩山童就封彭祖师为明教散人，身份跟教主平起平坐，地位超然。
与此同时，弥勒教的教主在一次大战中战死，经彭祖师提议，选出了一位能力出众的新教主，名叫彭太初。
这么一来，彭祖师就成为了元廷捉拿的头号要犯，有人更是戏称彭祖师为三教大总管，只要捉住了彭祖师，红巾军就会阵脚大乱，不堪一击。”
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